يؤهل برنامج الدكتوراه في أصول الفقه خريجيه للعمل في مجالات أكاديمية وقضائية وبحثية ومهنية متقدمة، تشمل العمل أعضاء هيئة تدريس وباحثين متخصصين في أصول الفقه ومناهج الاستدلال والاجتهاد الشرعي، ومستشارين وخبراء شرعيين في الجهات القضائية والعدلية، وهيئات الإفتاء، والهيئات واللجان الشرعية. كما يؤهلهم للعمل باحثين رئيسين في مراكز البحوث الشرعية والمؤسسات العلمية، وللعمل وفقًا للأنظمة والاشتراطات المهنية المعمول بها في السلك القضائي، والنيابة العامة، وأعمال التوثيق العدلي، وكتابات العدل، وممارسة المحاماة. ويؤهل البرنامج كذلك للعمل في مجالات الاستشارات الشرعية والقانونية، وتحقيق المخطوطات الأصولية والتراث الإسلامي، ومراجعة الإنتاج العلمي، إضافة إلى تولي المناصب القيادية والإشرافية في الجامعات، والمعاهد البحثية، والمراكز الأكاديمية والعلمية المتخصصة.